El Departamento de Innovación Educativa tiene como principales funciones: asesorar pedagógicamente a las comisiones y academias docentes para la implementación del Modelo Educativo Institucional en el diseño o rediseño de planes y programas de estudio, fomentar la investigación educativa, asesorar sobre métodos didácticos a docentes autores de los seminarios con opción a titulación generados en la escuela, coadyuvar con la Subdirección Académica para la revisión de la Planeación Didáctica al inicio del semestre, proponer acciones de mejora en los servicios educativos de las diferentes modalidades que ofrece la escuela, entre otros.